La struttura di Pokémon Giallo è molto simile a quella di Rosso/Blu, ma sono stati apportati qualche cambiamenti.
Le squadre dei capipalestra hanno subito dei cambiamenti e gli sprite dei Pokémon sono stati modificati. L'avventura naturalmente si svolgerà nella regione di Kanto, del resto come tutti gli altri videogiochi di 1° generazione Un particolare del gioco riguarda il Pikachu del personaggio giocante. Ricevuto all'inizio dell'avventura dal Professor Oak, camminerà dietro al protagonista (non sarà dentro una Poké Ball e non potrà evovlersi in Raichu, proprio come nell'Anime Pokémon). Per poter completare il Pokédex sarà necessario scambiare con altre versioni.
